1. 工业环境差
马来西亚因为地理位置的缘故，气候炎热潮湿，很多地方水源污染，还有部分地区有臭氧层破洞，等等，环境污染严重，对于读博士的学生来说，长期生活在这样的环境下势必会影响自身的身体健康和心理健康。并且，马来西亚的工业环境也存在着一定的隐患，大量企业排放废气、废水，会对周围的居民造成一定的影响，所以不建议去马来西亚读博士。
2. 文化差异大
由于独特的地理环境和多族文化的存在，马来西亚在文化方面与国内存在很大的差异，习惯和习俗也不同，这对于初次前往的学生来说会产生一定的文化冲击，可能会有一种“语言不通、文化不同，难以融入”的感觉，对学习和生活都会造成一定的困难。
3. 学费和生活费用高
和其他国家相比，马来西亚的学费和生活费用都比较高，特别是一些知名高校的学费更是高昂，加上生活费用还需要考虑住房、交通、餐费等等。虽然虽然有一些奖学金可以申请，但是获得的比例相对较低，获奖也比较困难，因此在经济上的压力是十分巨大的。
4. 拓展职业发展空间较小
人才的聚集地也会影响到个人职业发展的道路。虽然马来西亚有一定的经济和发展基础，但和发达国家相比，它在这方面的空间是相对较小的。国内一些知名高校和研究机构的毕业生，在求职市场上的竞争优势会更大一些，拥有更广阔的职业发展前景。
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