1. 缺乏优质研究生院
马来西亚没有像美国或欧洲那样的顶尖研究生院，这也是为什么许多高素质的学生可能会瞄准国外大学的原因之一。没有顶尖的研究生院和导师，学生很难得到高水平的研究机会，也很难得到国际前沿的研究资助。
2. 研究水平较为落后
马来西亚的整体研究水平还是较为落后的，尤其是在某些热门学科领域，学术发展相对滞后。这意味着在马来西亚读博士可能会导致在研究上受限制，缺乏深入的学术交流和探讨。
3. 就业竞争激烈
无论是在马来西亚还是国际上，博士毕业生都会面临激烈的就业竞争，而在马来西亚，由于缺乏整体发展水平较高的研究机构和大型企业，博士毕业生的就业前景也相对较为不利。此外，许多马来西亚本地的招聘者可能更倾向于本地毕业生，这意味着国际毕业生在这个领域会更加劣势。
4.生活成本高
尽管在住宿费和交通成本上可能较为便宜，但是生活成本在马来西亚仍然是相对较高的。此外，许多学校在马来西亚的学费也相对较高，部分学校排名较高的学院的学费可能更贵，这也会对学生造成巨大压力。
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